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科学研究

廖小林

来源:水生态所网站

1. 个人基本情况

廖小林,男,汉族,1978年4月出生,湖南澧县人,副研究员。主要从事鱼类生态基因组学与分子遗传学研究。在鱼类生态基因组学方面,初步建立了高效快速提取鱼类基因组DNA的高盐方法,开发了30多种海淡水鱼类的微卫星DNA标记,开展了几种长江鱼类的群体遗传学研究,为我国经济或生态重要鱼类的种质资源评价与保护提供了技术手段与基础资料。在鱼类分子遗传学方面,通过主持973项目课题与国家自然科学基金面上项目等项目,参与开展了牙鲆抗病分子育种与半滑舌鳎分子性别控制技术研究,筛选到多个与牙鲆抗病性状、半滑舌鳎性别紧密连锁的分子标记,构建了半滑舌鳎第一个遗传连锁图谱,建立了半滑舌鳎快速可靠的遗传性别分子鉴定方法。先后主持了973项目课题、国家自然科学基金面上项目、山东省农业良种工程项目等多项研究任务,在国内外学术刊物上发表研究论文近50篇,其中第一作者论文8篇(SCI论文7篇),获得授权发明专利3项(第一发明人1项),作为主要参加人员获得省部级奖励6项。

2. 联系方式

单位名称:水利部中国科学院pp真人娱乐网址投注

地址:湖北省武汉市雄楚大街578号,邮编:430079

电子邮件:xliao@mail.ihe.ac.cn

3. 主要学习和工作经历

1997.09-2001.07:青岛海洋大学水产养殖系学习,获得农学学士学位

2001.09-2006.07:中国科学院水生生物研究所学习,获得遗传学博士学位

2006.07-2009.12:中国水产科学研究院黄海水产研究所工作,任助理研究员

2010.01-2013.06:中国水产科学研究院黄海水产研究所工作,任副研究员

2012.02-2013.02:美国内布拉斯加大学奥马哈分校访学研究,国家公派访问学者

2013.06-现在: 水利部中国科学院pp真人娱乐网址投注工作,任副研究员

4. 主要学术兼职

青岛市青年蓝色经济区建设研究会会员

中国水产学会会员

中国水产学会水产生物技术专业委员会会员

5. 主要科研经历

2013.09-2016.12 主持大唐观音岩水电开发有限公司项目:“金沙江中游河段观音岩水电站相关科研工作”(530万元)

2010.01-2014.10 主持科技部国家重点基础研究发展计划(973计划)项目课题:“鱼类抗病基因调控网络和分子设计育种的基础研究”(2010CB126303,505万元)

2009.01-2011.12 主持国家自然科学基金面上项目:“牙鲆抗病相关微卫星标记的筛选及其应用潜力研究”(30871918,30万元)

2010.01-2012.12 主持山东省农业良种工程项目课题:“水产抗逆、性控种质创新利用研究”(100万元)

2009.01-2013.12 主持公益性行业(农业)科研专项子课题:“鲫等鱼类分子标记和基因标记开发”(200903045-1,95万元)

2009.1-2010.12 主持中国水产科学研究院黄海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目:“半滑舌鳎BAC 文库末端测序及基因资源筛选”(18万元)

2007.01-2008.12 主持中国水产科学研究院黄海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目:“我国重要海水养殖鱼类的微卫星DNA标记开发”(20万元)

6. 获奖情况

2012年 “牙鲆良种培育技术的建立及’鲆优1号’新品种创制和应用”,青岛市科技进步一等奖,排名第6位

2009年 “海水养殖鱼类遗传资源发掘与推广应用”,中华农业科技奖一等奖,排名第11位

2009年 “海水鱼类基因资源发掘与应用”,山东省科技进步奖二等奖,排名第6位

2009年 “海水养殖鱼类基因资源发掘、种质创制与应用”,国家海洋局海洋创新成果奖二等奖,排名第7位

2009年 “重要海水养殖鱼类基因资源发掘与应用”,中国水产科学研究院科技进步奖一等奖,排名第6位

2009年 “重要海水养殖鱼类基因资源发掘、种质创新与应用”,中国水产学会范蠡科学技术奖一等奖,排名第9位

7. 发表的主要研究论文

1) Liao X, Cheng L, Xu P, Lu G, Wachholtz M, Sun X, Chen S. Transcriptome analysis of crucian carp (Carassius auratus), an important aquaculture and hypoxia-tolerant species. PLoS ONE, 2013, 8(4): e62308. doi:10.1371/journal.pone.0062308.

2) Wang TT, Wang N, Liao XL, Meng L, Liu Y, Chen SL. Cloning, molecular characterization and expression analysis of heat shock cognate 70 (Hsc70) cDNA from turbot (Scophthalmus maximus). Fish Physiology and Biochemistry, 2013, 39:1377-1386.

3) Song W, Pang R, Niu Y, Gao F, Zhao Y, Zhang J, Sun J, Shao C, Liao X, Wang L, Tian Y, Chen S. Construction of high-density genetic linkage maps and mapping of growth-related quantitative trait loci in the Japanese flounder (Paralichthys olivaceus). PLoS ONE, 2012, 7(11):e50404.

4) Song W, Li Y, Zhao Y, Liu Y, Niu Y, Pang R, Miao G, Liao X, Shao C, Gao F, Chen L. Construction of a high-density microsatellite genetic linkage map and mapping of sexual and growth-related traits in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis). PLoS ONE 2012, 7(12): e52097.

5) Chen SL, Ji XS, Shao CW, Li WL, Yang JF, Liang Z, Liao XL, Xu GB, Xu Y, Song WT. Induction of mitogynogenetic diploids and identification of WW super-female using sex-specific SSR markers in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis). Marine Biotechnology, 2012, 14(1):120-128.

6) 牛余泽,廖小林,宋文涛,王磊,赵永伟,高峰涛,陈松林。牙鲆遗传作图及生长性状QTL定位。水产学报,2012, 36(11):1640-1649。

7) Sha ZX, Luo XH, Liao XL, Wang SL, Wang QL, Chen SL. Development and characterization of 60 novel EST-SSR markers in half-smooth tongue sole Cynoglossus semilaevis. Journal of Fish Bioology, 2011, 78(1):322-331.

8) Du M, Chen SL, Liang Y, Wang L, Gao FT, Liu Y, Liao XL. Polymorphism and balancing selection of MHC Class II DAB gene in 7 selective flounder (Paralichthys olivaceus) families. Evidence-based Complementary and Alternative Medicine, 2011, 2011:613629.

9) Liao XL, Ma HY, Xu GB, Shao CW, Tian YS, Ji XS, Yang JF, Chen SL. Construction of a genetic linkage map and mapping of a female-specific DNA marker in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis). Marine Biotechnology, 2009, 11:699-709.

10) Chen SL, Miao G.D, Shao CW, Tian YS, Liao X. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci from fat greenling (Hexagrammos otakii). Conservation Genetics, 2009, 10(5):1429-1431.

11) Chen SL, Tian YS, Yang JF, Shao CW, Ji XS, Zhai JM, Liao XL, Zhuang ZM, Su PZ, Xu JY, Sha ZX, Wu PF, Wang N. Artificial gynogenesis and sex determination in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis). Marine Biotechnology, 2009, 11(2): 243-251.

12) Chen SL, Xing SC, Xu GB, Liao X, Yang JF. Isolation and characterization of 10 polymorphic microsatellite loci from small yellow croaker (Pseudosciaena polyactis). Conservation Genetics, 2009, 10(5):1469-1471.

13) Chen SL, Zhao L, Shao CW, Liao X., Tian Y. S. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci from black sea bass (Centropristis striata) and cross-species amplification. Conservation Genetics, 2009, 10(4): 1101-1103.

14) Ji XS, Chen S.L, Liao X.L., Yang J.F., Xu TJ, Ma H.Y, Tian YS, Jiang Y.L, Wu P.F. Microsatellite-centromere mapping in Cynoglossus semilaevis using gynogenetic diploid families produced by the use of homologous and non-homologous sperm. Journal of Fish Biology, 2009, 75(2): 422-434.

15) Ji XS, Chen S.L, Ma H.Y, Xu TJ, Liao X.L., Jiang Y.L. Isolation and characterization of 19 EST-linked polymorphic microsatellite loci for olive flounder (Paralichthys olivaceus). Aquaculture Research, 2009, 40(8): 980-983.

16) Zheng JS, Liao XL, Tong JG, Du HJ, Milinkovitch MC, Wang D. Development and characterization of polymorphic microsatellite loci in the endangered Yangtze finless porpoise (Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis). Conservation Genetics, 2008, 9:1007-009.

17) Shao CW, Liao X, Chen SL. Isolation and characterization of microsatellite DNA loci from the southern flounder, Paralichthys lethostigma. Molecular Ecology Resources, 2008, 8(2), 381-383.

18) Chen SL, Shao CW, Xu GB, Liao XL, Tian YS. Development of 15 novel dinucleotide microsatellite markers in the Senegalese sole Solea senegalensis. Fisheries Science, 2008, 74: 1357-1359.

19) Chen SL, Ma HY, Jiang Y, Liao XL. Meng L. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci from an EST-library of turbot (Scophthalmus maximus) and cross-species amplification. Molecular Ecology Notes, 2007, 7:848-850.

20) Liao X, Wang D, Yu X, Li W, Cheng L, Wang J, Tong J. Characterization of novel microsatellite loci in rare minnow (Gobiocypris rarus) and amplification in closely related species in Gobioninae. Conservation Genetics, 2007, 8:1003-1007.

21) Liao X, Yu X, Chang J, Tong J. Polymorphic microsatellites in largemouth bronze gudgeon (Coreius guichenoti) developed from repeat-enriched libraries and cross-species amplifications. Molecular Ecology Notes, 2007, 7(6): 1104-1107.

22) Liao X, Shao CW, Tian YS, Chen SL. Polymorphic dinucleotide microsatellites in tongue sole (Cynoglossus semilaevis). Molecular Ecology Notes, 2007, 7(6):1147-1149.

23) Wang D, Liao X, Cheng L, Yu X, Tong J. Development of novel EST-SSR markers in common carp by data mining from public EST sequences. Aquaculture, 2007, 271:558-574.

24) Cheng L, Liao X, Yu X, Tong J. Development of EST-SSRs by an efficient FIASCO-based strategy: a case study in rare minnow (Gobiocyrpis rarus). Animal Biotechnology, 2007, 18(3):143-152.

25) Li WT, Liao XL, Yu XM, Cheng L, Tong J. Isolation and characterization of polymorphic microsatellites in a sex-reversal fish, rice field eel (Monopterus albus). Molecular Ecology Notes, 2007, 7:705-707.

26) Li WT, Liao XL, Yu XM, Wang D, Tong J. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in Wuchang bream (Megalobrama amblycephala). Molecular Ecology Notes, 2007, 7:771-773.

27) Liao X, Zhu B, Yu X, Tan D, Chang J, Tong J. Isolation and characterization of polymorphic microsatellites in a Yangtze River fish, brass gudgeon (Coreius heterodon Bleeker). Molecular Ecology Notes, 2006, 6(2):393-395.

 28) Liao X, Yu X, Tong J. Genetic diversity of common carp from two largest Chinese lakes and the Yangtze River revealed by microsatellite markers. Hydrobiologia, 2006, 568:445-453.

29) Zhang B, Li ZJ, Tong JG, Liao XL. Isolation and characterization of 18 polymorphic microsatellite markers in Chinese mandarin fish Siniperca chuatsi (Basilewsky). Molecular Ecology Notes, 2006, 6(4):1216-1218.

30) 廖小林,俞小牧,谭德清,童金苟。长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA 分析。水生生物学报,2005, 29(2): 113-119。

31) Tong J, Yu X, Liao X. Characterization of a highly conserved microsatellite marker with utility potentials in cyprinid fishes. Journal of Applied Ichthyology, 2005, 21:232-235.

32) Zhu B, Liao X, Shao Z, Rosenthal H, Chang J. Isolation and characterization of microsatellites in Chinese sturgeon, Acipenser sinensis. Molecular Ecology Notes, 2005, 5:888-892.

8. 授权发明专利

廖小林,陈松林,徐亘博,刘海金,徐营。“半滑舌鳎性别连锁的微卫星标记及遗传性别鉴定方法”,专利号:ZL201010239729.6。

陈松林,杨景峰,苏鹏志,翟介明,田永胜,廖小林,邵长伟。“鱼类异源冷冻精子诱导雌核发育的方法”,专利号:ZL200710016988.0。

陈松林,田永胜,杨景峰,翟介明,邵长伟,廖小林,苏鹏志,季相山,徐建勇,武鹏飞。“半滑舌鳎雌核发育二倍体鱼苗的诱导方法”,专利号:ZL200910262682.2。

9. 特邀会议报告

2009年6月2-3日,以特邀专家身份在中国科协第29期新观点新学说学术沙龙(山东青岛)做了题为“分子标记与水产种质鉴定和物种保护”的主题报告,报告内容被收录到中国科学技术协会编辑出版的《基因资源与现代渔业》文集中。

2013年11月16-17日,以特邀报告人身份在中国科协第264次青年科学家论坛“水产动物育种与生物技术”(湖北武汉)做了题为“鲫(Carassius auratus)转录组分析与分子标记开发”的主题报告。